MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB5

Total Repeats: 2575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009930	TAT	2	6	33214	33219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340956
502	NC_009930	CAC	2	6	33294	33299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340956
503	NC_009930	GCC	2	6	33346	33351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340956
504	NC_009930	CCT	2	6	33548	33553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340957
505	NC_009930	TCA	2	6	33632	33637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340957
506	NC_009930	TGA	2	6	33652	33657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340958
507	NC_009930	GAG	2	6	33701	33706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340958
508	NC_009930	TGA	2	6	33709	33714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340958
509	NC_009930	ACA	2	6	33729	33734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340958
510	NC_009930	TCCT	2	8	33828	33835	0 %	50 %	0 %	50 %	158340959
511	NC_009930	GCG	2	6	33850	33855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340959
512	NC_009930	AAC	2	6	33967	33972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340959
513	NC_009930	GGTTTG	2	12	34099	34110	0 %	50 %	50 %	0 %	158340960
514	NC_009930	TCT	2	6	34130	34135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340960
515	NC_009930	GGA	2	6	34136	34141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340960
516	NC_009930	TGGC	2	8	34170	34177	0 %	25 %	50 %	25 %	158340960
517	NC_009930	TGGT	2	8	34189	34196	0 %	50 %	50 %	0 %	158340960
518	NC_009930	GT	3	6	34195	34200	0 %	50 %	50 %	0 %	158340960
519	NC_009930	AGC	2	6	34202	34207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340960
520	NC_009930	TTAA	2	8	34209	34216	50 %	50 %	0 %	0 %	158340960
521	NC_009930	CTAC	2	8	34319	34326	25 %	25 %	0 %	50 %	158340960
522	NC_009930	TTC	2	6	34465	34470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340960
523	NC_009930	AAC	2	6	34507	34512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340960
524	NC_009930	AGCA	2	8	34713	34720	50 %	0 %	25 %	25 %	158340961
525	NC_009930	TGGA	2	8	34777	34784	25 %	25 %	50 %	0 %	158340961
526	NC_009930	TCG	2	6	34831	34836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340961
527	NC_009930	CAC	2	6	34851	34856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340961
528	NC_009930	TTC	2	6	34864	34869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340961
529	NC_009930	TGA	2	6	34934	34939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340961
530	NC_009930	TCA	2	6	35092	35097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340962
531	NC_009930	CAG	2	6	35157	35162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340962
532	NC_009930	ATC	2	6	35163	35168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340962
533	NC_009930	TA	3	6	35218	35223	50 %	50 %	0 %	0 %	158340962
534	NC_009930	GTC	2	6	35226	35231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340962
535	NC_009930	CTA	2	6	35241	35246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340962
536	NC_009930	AGC	2	6	35345	35350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340963
537	NC_009930	TC	3	6	35423	35428	0 %	50 %	0 %	50 %	158340963
538	NC_009930	TCA	2	6	35440	35445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340963
539	NC_009930	TTG	2	6	35492	35497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340963
540	NC_009930	ATCAG	2	10	35538	35547	40 %	20 %	20 %	20 %	158340963
541	NC_009930	CTC	2	6	35570	35575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340963
542	NC_009930	TTC	2	6	35630	35635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340963
543	NC_009930	TCA	2	6	35641	35646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340963
544	NC_009930	TCT	2	6	35725	35730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340964
545	NC_009930	AGA	2	6	35788	35793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340964
546	NC_009930	CAA	2	6	35842	35847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340964
547	NC_009930	CCT	2	6	35880	35885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340964
548	NC_009930	CGT	2	6	35916	35921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340964
549	NC_009930	TCT	2	6	35946	35951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340964
550	NC_009930	TTG	2	6	36105	36110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340965
551	NC_009930	TC	3	6	36381	36386	0 %	50 %	0 %	50 %	158340966
552	NC_009930	CTC	2	6	36399	36404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340966
553	NC_009930	A	6	6	36414	36419	100 %	0 %	0 %	0 %	158340966
554	NC_009930	GAA	2	6	36429	36434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340966
555	NC_009930	GAT	2	6	36465	36470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340966
556	NC_009930	ATTG	2	8	36509	36516	25 %	50 %	25 %	0 %	158340966
557	NC_009930	TTCA	2	8	36525	36532	25 %	50 %	0 %	25 %	158340966
558	NC_009930	CTT	2	6	36550	36555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340966
559	NC_009930	CAA	2	6	36573	36578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340966
560	NC_009930	TGA	2	6	36685	36690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340966
561	NC_009930	GA	3	6	36733	36738	50 %	0 %	50 %	0 %	158340966
562	NC_009930	TGAG	2	8	36771	36778	25 %	25 %	50 %	0 %	158340966
563	NC_009930	A	6	6	36863	36868	100 %	0 %	0 %	0 %	158340967
564	NC_009930	ATC	2	6	37054	37059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340968
565	NC_009930	TC	3	6	37187	37192	0 %	50 %	0 %	50 %	158340968
566	NC_009930	ACG	2	6	37195	37200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340968
567	NC_009930	TC	3	6	37202	37207	0 %	50 %	0 %	50 %	158340968
568	NC_009930	TTAAGT	2	12	37538	37549	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158340969
569	NC_009930	GAT	2	6	37656	37661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340969
570	NC_009930	AAC	2	6	37842	37847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340970
571	NC_009930	AATCCC	2	12	38057	38068	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	158340971
572	NC_009930	ACC	2	6	38072	38077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340971
573	NC_009930	TAAA	2	8	38231	38238	75 %	25 %	0 %	0 %	158340971
574	NC_009930	GGTTT	2	10	38248	38257	0 %	60 %	40 %	0 %	158340971
575	NC_009930	CAAT	2	8	38483	38490	50 %	25 %	0 %	25 %	158340972
576	NC_009930	ACCC	2	8	38491	38498	25 %	0 %	0 %	75 %	158340972
577	NC_009930	GAC	2	6	38692	38697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340973
578	NC_009930	ACG	2	6	38742	38747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340973
579	NC_009930	TCCA	2	8	38749	38756	25 %	25 %	0 %	50 %	158340973
580	NC_009930	ACC	2	6	38892	38897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340974
581	NC_009930	AG	3	6	38927	38932	50 %	0 %	50 %	0 %	158340974
582	NC_009930	CAT	2	6	38959	38964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340974
583	NC_009930	TCA	2	6	39063	39068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340974
584	NC_009930	TACC	2	8	39070	39077	25 %	25 %	0 %	50 %	158340974
585	NC_009930	CAG	2	6	39146	39151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340974
586	NC_009930	GGAAC	2	10	39179	39188	40 %	0 %	40 %	20 %	158340974
587	NC_009930	CCTAGA	2	12	39211	39222	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158340974
588	NC_009930	GAA	2	6	39259	39264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340974
589	NC_009930	CTG	2	6	39305	39310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340974
590	NC_009930	AAGC	2	8	39311	39318	50 %	0 %	25 %	25 %	158340974
591	NC_009930	CGC	2	6	39343	39348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340974
592	NC_009930	CCT	2	6	39511	39516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340974
593	NC_009930	ACA	2	6	39597	39602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340974
594	NC_009930	TCCAG	2	10	39615	39624	20 %	20 %	20 %	40 %	158340974
595	NC_009930	GCT	2	6	39635	39640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340974
596	NC_009930	CAA	2	6	39761	39766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340975
597	NC_009930	TGA	2	6	39889	39894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340976
598	NC_009930	ACT	2	6	39904	39909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340976
599	NC_009930	CAC	2	6	39953	39958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340976
600	NC_009930	AT	3	6	39989	39994	50 %	50 %	0 %	0 %	158340976
601	NC_009930	GCC	2	6	40206	40211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340977
602	NC_009930	A	6	6	40215	40220	100 %	0 %	0 %	0 %	158340977
603	NC_009930	TCA	2	6	40313	40318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340977
604	NC_009930	GTC	2	6	40321	40326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340978
605	NC_009930	GAT	2	6	40390	40395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340978
606	NC_009930	TCC	3	9	40472	40480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340978
607	NC_009930	ACC	2	6	40493	40498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340978
608	NC_009930	CCAC	2	8	40529	40536	25 %	0 %	0 %	75 %	158340978
609	NC_009930	TCA	2	6	40547	40552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340978
610	NC_009930	GCT	2	6	40576	40581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340978
611	NC_009930	CA	3	6	40607	40612	50 %	0 %	0 %	50 %	158340978
612	NC_009930	AAG	2	6	40614	40619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340978
613	NC_009930	ACA	2	6	41245	41250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340979
614	NC_009930	AAG	2	6	41538	41543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340980
615	NC_009930	AGC	2	6	41567	41572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340980
616	NC_009930	T	6	6	41625	41630	0 %	100 %	0 %	0 %	158340980
617	NC_009930	GTT	3	9	41716	41724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340981
618	NC_009930	ACC	3	9	41788	41796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340981
619	NC_009930	AGC	2	6	41908	41913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340981
620	NC_009930	ACC	3	9	41914	41922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340981
621	NC_009930	CCG	2	6	41930	41935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340981
622	NC_009930	CCG	2	6	42014	42019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340981
623	NC_009930	TAA	2	6	42129	42134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340981
624	NC_009930	AGTC	2	8	42202	42209	25 %	25 %	25 %	25 %	158340981
625	NC_009930	AAT	2	6	42211	42216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340981
626	NC_009930	AAT	2	6	42223	42228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340981
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628	NC_009930	TTTG	2	8	42473	42480	0 %	75 %	25 %	0 %	158340981
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